Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf518bB2RRE4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Znf518bB2RRE4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf518bB2RRE4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms