Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Proca1B0QZF7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Proca1B0QZF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Proca1B0QZF7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Proca1B0QZF7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms