Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp11A9YVJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp11A9YVJ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms