Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skint2A7XUX6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms