Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2A3KGV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf2A3KGV1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms