Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pm20d2A3KG59 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pm20d2A3KG59 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms