Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Palm3A2TJV2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Palm3A2TJV2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Palm3A2TJV2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Palm3A2TJV2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Palm3A2TJV2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Palm3A2TJV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palm3A2TJV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Palm3A2TJV2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms