Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms