Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef17A2ASJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramef17A2ASJ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms