Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn1aA2APX8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms