Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabreA2AMW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GabreA2AMW3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabreA2AMW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms