Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm12A2AJ77 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm12A2AJ77 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms