Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Camsap1A2AHC3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Camsap1A2AHC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap1A2AHC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Camsap1A2AHC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms