Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34dA2AGU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms