Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ckap5A2AGT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ckap5A2AGT5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ckap5A2AGT5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms