Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc163A2AGD7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms