Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd4A2AFR3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd4A2AFR3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms