Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyb561d1A2AE42 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms