Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87977A2A958 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87977A2A958 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87977A2A958 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87977A2A958 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87977A2A958 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C87977A2A958 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C87977A2A958 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87977A2A958 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms