Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Gm28360A0A087WR25 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Gm28360A0A087WR25 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28360A0A087WR25 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gm28360A0A087WR25 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm28360A0A087WR25 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28360A0A087WR25 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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