Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28919A0A087WP35 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm28919A0A087WP35 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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