Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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