Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms