Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Letm1Q9Z2I0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letm1Q9Z2I0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letm1Q9Z2I0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Letm1Q9Z2I0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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