Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms