Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rps6ka4Q9Z2B9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms