Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl8Q9Z121 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccl8Q9Z121 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl8Q9Z121 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms