Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms