Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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