Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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