Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms