Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms