Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Dkk3Q9QUN9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk3Q9QUN9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Dkk3Q9QUN9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Dkk3Q9QUN9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Dkk3Q9QUN9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms