Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms