Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cabp1Q9JLK7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms