Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nectin3Q9JLB9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nectin3Q9JLB9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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