Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Habp4Q9JKS5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms