Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms