Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scamp5Q9JKD3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms