Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms