Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms