Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms