Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sall1Q9ER74 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms