Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms