Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnft1Q9DCN7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms