Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms