Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cyp27a1Q9DBG1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp27a1Q9DBG1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms