Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9S1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D9S1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms