Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms