Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lin37Q9D8N6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms